3 Guerrilla Analytics
The Guerrilla Analytics framework represents a pragmatic approach to data science projects, emphasizing efficiency, adaptability, and practicality in tackling complex analytical challenges. Its significance lies in its ability to streamline project management, optimize resource utilization, and foster rapid iteration and learning. This framework empowers data scientists to navigate through the intricacies of real-world data projects with agility and effectiveness, ultimately driving tangible results and insights.
In my DAUR-II project, I’ve organized my folder structure according to the Guerrilla Analytics framework.
I did the same for my portfolio:
## C:/Users/kzzba/Downloads/bookdown_khadija
## ├── 01_Cv.Rmd
## ├── 01_Vooruitblikken.Rmd
## ├── 03_Eigen_opdracht.Rmd
## ├── 04_Tidy_maken.Rmd
## ├── 05_Celegans_plateexperiment.Rmd
## ├── 06_Peer_review.Rmd
## ├── 07_R_package.Rmd
## ├── 08_Antimicrores.Rmd
## ├── 09_Parameters.Rmd
## ├── 10_References.Rmd
## ├── AirQualityUCI.csv
## ├── AirQualityUCI.xlsx
## ├── benztropine.png
## ├── bookdown_khadija.Rproj
## ├── clusterProfiler
## │ ├── CITATION
## │ ├── data
## │ │ ├── DE_GSE8057.rda
## │ │ ├── gcSample.rda
## │ │ ├── kegg_category.rda
## │ │ └── kegg_species.rda
## │ ├── DESCRIPTION
## │ ├── doc
## │ │ ├── clusterProfiler.html
## │ │ ├── clusterProfiler.R
## │ │ ├── clusterProfiler.Rmd
## │ │ └── index.html
## │ ├── extdata
## │ │ ├── build_kegg_species.R
## │ │ ├── c5.cc.v5.0.entrez.gmt
## │ │ ├── kegg-mapper-blast.txt
## │ │ ├── kegg_pathway_category.r
## │ │ ├── kegg_taxa.rds
## │ │ └── wikipathways-20180810-gmt-Homo_sapiens.gmt
## │ ├── help
## │ │ ├── aliases.rds
## │ │ ├── AnIndex
## │ │ ├── clusterProfiler.rdb
## │ │ ├── clusterProfiler.rdx
## │ │ └── paths.rds
## │ ├── html
## │ │ ├── 00Index.html
## │ │ └── R.css
## │ ├── INDEX
## │ ├── MD5
## │ ├── Meta
## │ │ ├── data.rds
## │ │ ├── features.rds
## │ │ ├── hsearch.rds
## │ │ ├── links.rds
## │ │ ├── nsInfo.rds
## │ │ ├── package.rds
## │ │ ├── Rd.rds
## │ │ └── vignette.rds
## │ ├── NAMESPACE
## │ ├── NEWS
## │ ├── NEWS.md
## │ └── R
## │ ├── clusterProfiler
## │ ├── clusterProfiler.rdb
## │ └── clusterProfiler.rdx
## ├── clusterProfiler_Overview_Wu_et_al_2021.png
## ├── data.csv
## ├── dds.rds
## ├── dme04130.pathview.pdf
## ├── dme04130.pathview.png
## ├── dme04130.png
## ├── dme04130.xml
## ├── Docs
## ├── drosphila_example_de.csv
## ├── figure1A.png
## ├── figure1B.png
## ├── hsa04060.pathview.png
## ├── hsa04060.png
## ├── hsa04060.xml
## ├── hsa04750.pathview.png
## ├── hsa04750.png
## ├── hsa04750.xml
## ├── Images
## ├── index.Rmd
## ├── ireland.png
## ├── maps.png
## ├── newplot_sweden.png
## ├── notes_package
## ├── pathview.png
## ├── pathway.png
## ├── Raw_data
## │ ├── celegans
## │ │ ├── CE.LIQ.FLOW.062_Tidydata (1).xlsx
## │ │ └── README.md
## │ ├── eigen_opdracht
## │ ├── package
## │ └── reproducibility
## │ ├── all-2024-05-04.rda
## │ ├── countries-2024-05-04.rda
## │ ├── figure1A-2024-05-04.pdf
## │ ├── Figure1ab_covid-19_reproducibility.Rmd
## │ └── figure1B-2024-05-04.pdf
## ├── README
## ├── references
## │ ├── files
## │ │ ├── 11
## │ │ │ └── _.pdf
## │ │ ├── 4
## │ │ │ └── _.pdf
## │ │ └── 8
## │ │ └── _.pdf
## │ ├── references
## │ │ └── files
## │ │ └── 4
## │ │ └── _.pdf
## │ └── references.bib
## ├── shinyapp.png
## ├── sweden.png
## ├── _book
## │ ├── 404.html
## │ ├── antimicrobial-resistance-project.html
## │ ├── antimicrobial-resistance-projecticum.html
## │ ├── applying-the-guerrilla-analytics-framework-to-my-own-project.html
## │ ├── availability.png
## │ ├── benztropine.png
## │ ├── c.-elegans-plate-experiment.html
## │ ├── c.elegans-plate-experiment.html
## │ ├── clusterProfiler_Overview_Wu_et_al_2021.png
## │ ├── computer.png
## │ ├── contact.html
## │ ├── curriculum-vitae-khadija-zbair.html
## │ ├── curriculum-vitae.html
## │ ├── dme04130.pathview.png
## │ ├── education.html
## │ ├── eigen-opdracht-vrije-ruimte.html
## │ ├── figure1A.png
## │ ├── figure1B.png
## │ ├── future-outlook.html
## │ ├── gathering-data-and-annotations.html
## │ ├── guerrilla-analytics.html
## │ ├── hobbies.html
## │ ├── hsa04060.png
## │ ├── hsa04750.pathview.png
## │ ├── hsa04750.png
## │ ├── index.html
## │ ├── ireland.png
## │ ├── job-experience.html
## │ ├── kegg-gene-set-enrichment-analysis.html
## │ ├── libs
## │ │ ├── anchor-sections-1.1.0
## │ │ │ ├── anchor-sections-hash.css
## │ │ │ ├── anchor-sections.css
## │ │ │ └── anchor-sections.js
## │ │ ├── bsTable-3.3.7
## │ │ │ ├── bootstrapTable.js
## │ │ │ └── bootstrapTable.min.css
## │ │ ├── core-js-2.5.3
## │ │ │ └── shim.min.js
## │ │ ├── crosstalk-1.2.1
## │ │ │ ├── css
## │ │ │ │ └── crosstalk.min.css
## │ │ │ └── js
## │ │ │ └── crosstalk.min.js
## │ │ ├── gitbook-2.6.7
## │ │ │ ├── css
## │ │ │ │ ├── fontawesome
## │ │ │ │ │ └── fontawesome-webfont.ttf
## │ │ │ │ ├── plugin-bookdown.css
## │ │ │ │ ├── plugin-clipboard.css
## │ │ │ │ ├── plugin-fontsettings.css
## │ │ │ │ ├── plugin-highlight.css
## │ │ │ │ ├── plugin-search.css
## │ │ │ │ ├── plugin-table.css
## │ │ │ │ └── style.css
## │ │ │ └── js
## │ │ │ ├── app.min.js
## │ │ │ ├── clipboard.min.js
## │ │ │ ├── jquery.highlight.js
## │ │ │ ├── plugin-bookdown.js
## │ │ │ ├── plugin-clipboard.js
## │ │ │ ├── plugin-fontsettings.js
## │ │ │ ├── plugin-search.js
## │ │ │ └── plugin-sharing.js
## │ │ ├── htmltools-fill-0.5.8.1
## │ │ │ └── fill.css
## │ │ ├── htmlwidgets-1.6.4
## │ │ │ └── htmlwidgets.js
## │ │ ├── jquery-3.6.0
## │ │ │ └── jquery-3.6.0.min.js
## │ │ ├── kePrint-0.0.1
## │ │ │ └── kePrint.js
## │ │ ├── lightable-0.0.1
## │ │ │ └── lightable.css
## │ │ ├── plotly-binding-4.10.4
## │ │ │ └── plotly.js
## │ │ ├── plotly-htmlwidgets-css-2.11.1
## │ │ │ └── plotly-htmlwidgets.css
## │ │ ├── plotly-main-2.11.1
## │ │ │ └── plotly-latest.min.js
## │ │ ├── react-18.2.0
## │ │ │ ├── react-dom.min.js
## │ │ │ └── react.min.js
## │ │ ├── reactable-0.4.4
## │ │ │ └── reactable.css
## │ │ ├── reactable-binding-0.4.4
## │ │ │ └── reactable.js
## │ │ ├── reactwidget-1.0.0
## │ │ │ └── react-tools.js
## │ │ └── typedarray-0.1
## │ │ └── typedarray.min.js
## │ ├── location.png
## │ ├── making-an-r-package.html
## │ ├── maps.png
## │ ├── marokko.png
## │ ├── mastering-pathway-analysis-using-clusterprofile-rpackage.html
## │ ├── newplot_sweden.png
## │ ├── parameterized-covid-19-report.html
## │ ├── parameters-on-covid-19-data.html
## │ ├── pathview.png
## │ ├── pathway-analysis-using-clusterprofile-r-package.html
## │ ├── pathway.png
## │ ├── profile.html
## │ ├── r-package.html
## │ ├── references-1.html
## │ ├── references-classsection-level2-unnumbered.html
## │ ├── references.html
## │ ├── refs.html
## │ ├── reproducible-research-peer-review.html
## │ ├── reproducible-research.html
## │ ├── search_index.json
## │ ├── section.html
## │ ├── shinyapp.png
## │ ├── skills.html
## │ ├── study_objective.png
## │ ├── sweden.png
## │ ├── title.png
## │ └── _main_files
## │ └── figure-html
## │ ├── kanarie-1.png
## │ ├── nonono-1.png
## │ ├── plotje-1.png
## │ ├── scatterplot1-1.png
## │ ├── scatterplot2-2.png
## │ ├── taylor-1.png
## │ ├── unnamed-chunk-10-1.png
## │ ├── unnamed-chunk-11-1.png
## │ ├── unnamed-chunk-12-1.png
## │ ├── unnamed-chunk-13-1.png
## │ ├── unnamed-chunk-14-1.png
## │ ├── unnamed-chunk-5-1.png
## │ ├── unnamed-chunk-6-1.png
## │ ├── unnamed-chunk-8-1.png
## │ └── unnamed-chunk-9-1.png
## ├── _bookdown_files
## ├── _main.Rmd
## └── _main_files
## └── figure-html
## ├── kanarie-1.png
## ├── nonono-1.png
## ├── plotje-1.png
## ├── scatterplot1-1.png
## ├── scatterplot2-2.png
## ├── taylor-1.png
## ├── unnamed-chunk-10-1.png
## ├── unnamed-chunk-11-1.png
## ├── unnamed-chunk-12-1.png
## ├── unnamed-chunk-13-1.png
## ├── unnamed-chunk-14-1.png
## ├── unnamed-chunk-2-1.png
## ├── unnamed-chunk-29-1.png
## ├── unnamed-chunk-31-1.png
## ├── unnamed-chunk-33-1.png
## ├── unnamed-chunk-5-1.png
## ├── unnamed-chunk-6-1.png
## ├── unnamed-chunk-7-1.png
## ├── unnamed-chunk-8-1.png
## └── unnamed-chunk-9-1.png